Comentário de artigos da Nature sobre o Covid-19 (Parte 04 )

O objetivo dessa série de posts é trazer contéudo relevante e acadêmico sobre o novo vírus que está assolando o mundo.

Nesse posts veremos 3 artigos da Nature, Structural and Microbiology, todos eles distintos de certa forma.

O artigo acima têm por objetivo mostrar uma classificação detalhada do nome e da “árvore genealógica” do SARS-CoV-2.

Além disso eles vão dar nesse texto as implicações da decisão do nome e das suas propriedades como patologia.

Isso é feito pela ICTV(International Committee on Taxonomy of Viruses) que cataloga diversos tipos de doenças virais e as deixam Open source para Pesquisadores e o público em geral.

(Nomenclaturas de organimos virais, sendo que a Positive-sense RNA se encaixa no grupo do Covid-19)

(Classificações de organismos virais, a do Covid-19 é Coronaviridae)

No site da ICTV eles também têm vários arquivos em Excel com dados detalhados dessa catalogação, o que é legal para fazer gráficos no matlab.

Esse é meio que um mini dicionário de alguns termos técnicos dentro da biologia.

O site é tem dados bem detalhados, e mostra uma catalogação majestosa e bem feita.

Para entendermos melhor como essa hierarquia biológica funciona, veja que o Domínio(Realm) define um sub-domínio, um sub-reino define um Reino e assim sucessivamente.

Obs: (Não estou a par dos nomes dessas classificações em português..)

A imagem acima mostra 3 tipos de coronavírus, o SARS-CoV teve a sua primeira aparição em humanos em 2003, sendo que o MERS, outro tipo de corona apareceu em 2012.

Todos eles atacando o sistema respiratório dos pacientes.

(Mapa de infeções por MERS-CoV ao redor do Mundo)

Quando um novo vírus emerge, é necessário definir a sua classificação RNA, sua família e espécie para sabermos se ele se trata de algo especialmente novo (Novel) ou não.

O SARS-CoV-2 está no Realm: Riboviria, na Ordem: Nidovirales, sub-ordem Cornidovirineae e família Coronavidae.

É necessário para se nomear um vírus, primeiro fazer uma comparação genômica, e ver o que mais se aproxima dele.

(Fonte: ScienceDirect)

(Fonte: Plos Pathogens)

(Fonte: ICTV)

Essas imagens mostram a visualização comparada do genoma dos vírus, sendo eles todos da mesma família do Corona.

Taxonomia desses das respectivas classes virais relacionadas ao Coronavírus. Embora nada seja 100% aqui, o artigo diz que há uma dúvida na posição taxonômica do Sub-gênero: Sarbecovirus.

O Paper enfatiza que o escopo patológico dessa doença e a sua transmissão diferem em muito do SARS-CoV-2. E até os metódos de diagnóstico da doença são estranhamente diferentes.

Tanto a letra “B” quando a “C” desse gráfico mostram a porcentagem de similaridade de cada vírus, sendo que com a bolinha preta essa probabilidade é maior.

Na parte de espécies, aparecem alguns animais relacionados a essa doença. Dentre eles o Morcego, o Ouriço e o rato chinês.

O artigo conclui que o SARS-CoV-2 (Covid-19) não é um descendente direto do SARS-CoV, mas eles são tão iguais geneticamente que o último provê informações importantes para entender o novo.

Por fim, a nomeação para certos tipos de vírus dificulta às vezes a cabeça de cientistas por diversos fatores, mas tanto ICTV quando o CSG software vão cada vez mais diminuir esse problema ou tentar pelo menos..

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